DWDD uitzending met Hans Clevers over colibactin productie bij darmcarcinoom

In een uitzending van De Wereld Draait Door van afgelopen week, 27 Februari 2020, werd er aandacht gegeven aan de nieuwe vondst van de onderzoeksgroep van onder andere Hans Clevers van het Hubrecht Instituut, over de correlatie tussen de E. Coli stam pks+ en het ontstaan van darmcarcinomen. Dit onderzoek liet zien dat bij ongeveer 10% van de patiënten met darmcarcinoom, deze bacteriestam werd aangetroffen, die de stof colibactin produceert, die DNA mutaties veroorzaakt. Dit is natuurlijk een mooie vondst voor de zorg, waarop mogelijk nieuwe therapiën gemaakt kunnen worden.

Echter, met behulp van onze DNA analyse kan deze soort nog niet gedetecteerd worden. Dit omdat de bacterie E. Coli binnen de huidige standaard niet verder gespecificeerd kan worden tot, bijvoorbeeld, de pks+ variant. Dit pks+ stuk is een extra stukje DNA wat niet gevonden wordt bij de "normale" E. Coli bacterie. Onze techniek en aansluitend laboratorium protocol, de zogenaamde 16S rRNA sequencing, bekijkt alléén het 16S rRNA gen, wat door haar variabiliteit een hoog onderscheidend vermogen heeft voor soorten, wat identificatie van bacteriën makkelijk maakt. Zodoende neemt deze techniek geen andere stukjes DNA, zoals het pks+ gen, mee in de analyse.

Wel zijn wij aan het kijken naar een manier waarop zulke biomarkers wel voor onze klanten beschikbaar kunnen worden gemaakt, en hopelijk aankomend jaar. 

Meer informatie